Algoritmos de Estimación de Distribuciones para el problema de la determinación de la cadena lateral de una protena

Download: PDF.

“Algoritmos de Estimación de Distribuciones para el problema de la determinación de la cadena lateral de una protena” by Roberto Santana, and J. A. Lozano, and P. Larrañaga. In Memorias del V Congreso Español de Algoritmos Evolutivos y Bioinspirados, (Tenerife, Spain), 2007, pp. 663-670.

Abstract

Este trabajo analiza diferentes mejoras a una aplicación precedente de los algoritmos de estimación de distribuciones (EDA) al problema de la determinación de la cadena lateral de una protena. EDAs simples como el UMDA han permitido la obtención de cadenas laterales con menor valor de energa que las obtenidas con otros métodos para diferentes secuencias. Sin embargo para algunas secuencias, los resultados obtenidos con el UMDA no mejoran aquellos obtenidos por otros métodos. Por lo tanto, un problema de interés consiste en el estudio de métodos para aumentar la eficacia de los EDAs en la obtención de cadenas laterales de protenas. Presentamos dos posibles alternativas utilizadas con este propósito: el uso de algoritmos de optimización local y el aprendizaje de modelos probabilticos que tienen en cuenta las interacciones entre las variables del problema. Los algoritmos introducidos son evaluados en un conjunto de instancias difles. Los resultados obtenidos en este conjunto son superiores a los alcanzados con algoritmos de optimización basados en inferencia

Download: PDF.

BibTeX entry:

@inproceedings{Santana_et_al:2007g,
   author = {Roberto Santana and and J. A. Lozano, and P. Larra{\~n}aga},
   title = {Algoritmos de Estimaci{\'o}n de Distribuciones para el
	problema de la determinaci{\'o}n de la cadena lateral de una
	protena},
   booktitle = {Memorias del V Congreso Espa{\~n}ol de Algoritmos
	Evolutivos y Bioinspirados},
   pages = {663-670},
   address = {Tenerife, Spain},
   year = {2007}
}

(This webpage was created with bibtex2web.)

Back to Roberto Santana publications.